感染性疾病

 线上资源    |      2025-04-03


Oxford Nanopore 测序

实时数据流

  • 立即获取可操作的结果,包括病原体鉴定、变异分析和抗菌耐药性

  • 当获得足够数据时停止测序 — 清洗并重复使用测序芯片

  • 综合型数据分析工具——包括用于实时种属鉴定和 AMR 分析的 EPI2ME

可扩展——从便携式到高通量

  • 使用便携式、低成本的 MinION 设备在任意地点测序,套装已包含测序试剂

  • 使用模块化 GridION 和 PromethION 扩展规模——适用于病原体和复杂宏基因组样本的超高通量测序,以及宿主基因组学等其他实验

灵活、按需

  • 根据您的需求调整测序规模——可在一台设备上运行 1 个至数千个样本

  • 随时对您需要的内容进行测序——无需分批处理样本

  • 解析完整基因组和质粒

  • 覆盖及解析具有挑战性的区域,包括结构变异和重复区域

  • 组装宏基因组样本的完整基因组

  • 区分密切相关的物种

简化的、可自动处理的工作流程



白皮书

利用实时分子流行病学来管控传染病疫情

从埃博拉、寨卡和 COVID-19 病毒,到抗菌耐药性细菌和真菌感染,了解全球研究人员如何使用便携式实时的纳米孔测序技术,为快速识别和控制传染病疫情提供支持。了解实时基因组流行病学如何支持跟踪新病原体变异,从而为感染控制和公共卫生政策提供信息。

COVID-19 资源

在我们的资源中心获取更多有关传染病的内容,包括入门指南、工作流程、白皮书和视频。

COVID-19 资源查看所有资源

Genomic epidemiology paper

下载基因组流行病学文献




Outbreak-sequencing-nanopore

查看大图阅读感染性疾病发表文章

疫情暴发测序

在爆发情况下使用纳米孔测序

传染病是一种日益严重的威胁。例如,仅在 2019 年,世界卫生组织就记录了 19 种不同传染病的 100 多起爆发,每一种都构成潜在的流行病或大流行风险。 便携式和可扩展的实时纳米孔测序已被用于支持快速识别和控制世界各地的许多传染病暴发,包括 SARS-CoV-2、埃博拉病毒、寨卡病毒、抗微生物细菌等。

“如果这种病毒引起了严重的爆发或大流行,我们的主动监测工作和疫苗研发将为疫苗生产提供大约 8 周的时间优势”

Rambo-Martin 及 Keller等人. mSphere e00822-19 (2020)

案例分析

COVID-19 社区和医院传染的局部控制

随着新一波疫情席卷英国,COVID-19 患者入院人数激增,剑桥大学医院也包括在内。 为了支持实施有效的疾病控制措施,了解传染病的传播地点和方式非常重要。 最近成立的英国 COVID-19 基因组测序联盟已开始行动。这是由多家医院、公共卫生机构和学术合作伙伴组成的分布式网络,位居世界领先地位,其使命是针对 SARS-CoV-2 样本提供快速、高通量的全基因组测序。 生成的分子流行病学数据对实施合适的当地和国家公共卫生政策至关重要。

“研究病毒的基因组有助于发掘隐匿或隐藏的传播情况。这是它的真正作用所在——您可以检测到疫情并在其发生时采取行动”

Estée Török,来自英国剑桥大学

请访问我们的应用页面,获取从种属鉴定到宏基因组组装和变异识别的详细信息。

COVID-19宏基因组学